Метагеномиката се дефинира като директният генетичен анализ на геноми, съдържащи се в проба от околната среда Първоначално полето започва с клониране на ДНК на околната среда, последвано от скрининг на функционална експресия [1], и след това бързо беше допълнен от директно произволно секвениране на ДНК на околната среда [2, 3].
Какъв е процесът на метагеномиката?
Метагеномика включва получаване на ДНК от всички микроорганизми в рамките на общност, без непременно да се идентифицират всички участващи видове. След като гените бъдат секвенирани и сравнени с идентифицирани последователности, функциите на тези гени могат да бъдат определени.
Каква техника се използва в метагеномиката?
Проба от микробната общност се събира от морска вода, седимент, животно гостоприемник или друго морско местообитание. След това събраните клетки се лизират и ДНК се екстрахира от техния лизат. Техниката, която прави възможна метагеномиката е shotgun sequencing, която секвенира произволни участъци от ДНК по нецеленасочен начин.
Какви са 3-те стъпки към метагеномичното изследване?
Стъпки и процес на метагеномика:
- Проба колекция:
- Извличане на ДНК:
- Подготовка на пробата:
- Примерен анализ:
Как се извършва функционалната метагеномика?
Функционалната метагеномика включва изолиране на ДНК от микробни общности за изследване на функциите на кодираните протеини. То включва клониране на ДНК фрагменти, експресиране на гени в заместител на гостоприемник и скрининг за ензимни активности.