Хомологичното моделиране получава триизмерната структура на целевия протеин въз основа на сходството между шаблон и целеви последователности и тази техника се оказва ефективна, когато става въпрос за изследване на мембранни протеини, които са трудни за кристализиране като GPCR, тъй като осигурява по-висока степен на разбиране на …
Какво е хомологично моделиране и защо е необходимо?
1.2.
Хомологичното моделиране е най-точният изчислителен метод за създаване на надеждни структурни модели и обикновено се използва в много биологични приложения. Хомоложното моделиране предсказва 3D структурата на заявен протеин чрез подравняване на последователността на шаблонните протеини.
Какъв е принципът на хомологичното моделиране?
Хомологичното моделиране е известно също като сравнително моделиране, предсказва протеинови структури въз основа на хомология на последователността с известни структури. Тя се основава на принципа, че „ ако два протеина споделят достатъчно голяма сходство в последователността, те вероятно имат много сходни триизмерни структури.“
Какво прави доброто моделиране на хомология?
Ако дефинираме "много успешен хомологичен модел" като такъв с <=2 Å rmsd от емпиричната структура, тогава шаблонът трябва да има >=60% идентичност на последователността с целта за успех скорост >70% Дори при висока идентичност на последователността (60%-95%), до един на всеки десет хомологични модела има rmsd >5 Å спрямо
Кое от следните е вярно за моделирането на хомология?
Обяснение: Както подсказва името, хомоложното моделиране предсказва протеинови структури на базата на хомология на последователността с известни структури Моделирането на хомология произвежда изцяло атомен модел, базиран на подравняване с шаблонни протеини…. Грешки, направени в стъпката на подравняване, не могат да бъдат коригирани в следните стъпки на моделиране.
