BLAST е компютърен алгоритъм, който е достъпен за използване онлайн на уебсайта на Националния център за биотехнологична информация (NCBI), както и на много други сайтове. BLAST може бързо да подравни и сравни ДНК последователност на заявка с база данни от последователности, което я прави критичен инструмент в текущите геномни изследвания.
BLAST основна база данни ли е?
BLAST е най-широко използваният софтуер в изследванията на биоинформатиката. Основната му функция е да сравнява интересна последователност, последователността от заявки, с последователности в голяма база данни BLAST, след което отчита най-добрите съвпадения или „попадения“, намерени в базата данни. Тази проста програма има две основни приложения.
NCBI база данни ли е?
НЦБИ разполага с серия от бази данни, свързани с биотехнологиите и биомедицината и е важен ресурс за биоинформационни инструменти и услуги. Основните бази данни включват GenBank за ДНК последователности и PubMed, библиографска база данни за биомедицинска литература. Други бази данни включват базата данни NCBI Epigenomics.
Използва ли се BLAST само в бази данни на NCBI?
BLAST е достъпен в мрежата на уебсайта на NCBI. Предлагат се различни типове BLAST според последователностите на заявките и целевите бази данни.
Как работи базата данни BLAST?
Как работи BLAST? BLAST идентифицира хомоложни последователности с помощта на евристичен метод, който първоначално намира кратки съвпадения между две последователности; по този начин методът не взема предвид цялото пространство на последователността. След първоначалното съвпадение, BLAST се опитва да започне локално подравняване от тези първоначални съвпадения.
