1.1 α-спирали. α-спирала е често срещан елемент от вторичната структура на протеина, образуван , когато аминокиселините се "навиват", за да образуват дясна спирала, където страничните вериги сочат от централната намотка (Фиг. 3.1A, B).
Какво причинява образуването на алфа спирали?
Алфа спиралата се характеризира с плътно усукване с дясната страна на аминокиселинната верига, което я кара да образува пръчкова форма. Водородните връзки между водорода в аминогрупата и кислорода в карбоксилната група на аминокиселината причиняват тази структура.
Как се образуват алфа спиралите и бета листовете?
Алфа спиралата се образува, когато полипептидните вериги се усукват в спирала Това позволява на всички аминокиселини във веригата да образуват водородни връзки помежду си…. Бета плисираният лист е полипептидни вериги, минаващи една от друга. Нарича се плисиран чаршаф заради вълнообразния вид.
Какви аминокиселини образуват спирали?
Различните аминокиселинни последователности имат различни склонности за образуване на α-спирална структура. Метионин, аланин, левцин, глутамат и лизин незаредени („MALEK“в аминокиселинните 1-буквени кодове) всички имат особено висока склонност към образуване на спирала, докато пролинът и глицинът имат слаби склонности към образуване на спирала.
Как се формира вторичната протеинова структура от първичната структура?
Първичната структура на протеина се определя единствено от неговата аминокиселинна последователност и е конструирана от пептидни връзки между съседни аминокиселинни остатъци. Вторичната структура е резултат от водородна връзка по протежение на полипептидния гръбнак, което води до алфа-спирали и бета-нагънати листове.
